El Proyecto Argentino Interinstitucional de Genómica de Sars-Cov-2 (PAIS) publicó un informe en el que indica que que casi el 60% de los casos de coronavirus en la Ciudad de Buenos Aires correspondieron a las variantes de Reino Unido y Manaos. El informe, que se hizo en base a los datos de mediados de abril, señaló además que, en el caso del conurbano bonaerense, las cepas llegaron al 38,4% de los infectados.

Sin embargo, la cepa conocida como Andina se encontró en el 33,3% de los casos porteños y en el 57% de los del conurbano en la semana epidemiológica (SE) 15, es decir desde el 11 al 17 de abril.

De acuerdo con el reporte número 20, Proyecto PAIS indicó que, según el resultado de los estudios hechos en la Ciudad de Buenos Aires, las cepas de preocupación -501Y.V1 (Reino Unido) y 501Y.V3 (Manaos)- mostraron un incremento desde semana 9 (desde el 28 de febrero al 6 de marzo) hasta la semana 15, con fluctuaciones, hasta alcanzar valores de frecuencia de detección del 27,1% para la variante Reino Unido y del 31,3% para Manaos en la semana 15, lo que suma un 58,4% Con respecto a casos con las variantes de interés epidemiológico -E484K (Río de Janeiro) y L452Q (coincidente con la variante Andina)- se presentaron en el 39,6% de los casos de la SE15.

El estudio indicó que las dos cepas preponderantes en la Ciudad de Buenos Aires son Manaos y Reino Unido

Asimismo, se detalló que la mutación P.2 de Río de Janeiro se detectó en el 6,3% de los casos, aunque todavía falta su confirmación por secuenciación de genoma completo. En relación a la cariante L452Q (compatible con el linaje C.37, conocida como "variante Andina") el reporte de Proyecto PAIS indica que se detectó en el 33,3% de los contagiados.

Finalmente, el informe detalla que no se han detectado casos de la mutación L452R (compatible con la variante de California) en las dos últimas semanas epidemiológicas analizadas. Sólo el 4,2% de las secuencias de la última semana analizada (SE15) corresponden a virus que han circulado en la primera ola en la Ciudad de Buenos Aires.

La situación en el Gran Buenos Aires

En relación al Gran Buenos Aires, el informe señaló que la variante de preocupación 501Y.V1 (Reino Unido) mostró un incremento desde la semana 9 hasta la semana 15, con fluctuaciones, hasta alcanzar valores de frecuencia de detección del 11,5% en la semana 15, en casos sin nexo epidemiológico con turismo. En tanto, la 501Y.V3 (Manaos) creció desde la semanas 12 hasta la semana 15, con fluctuaciones, hasta alcanzar valores de detección del 26,9% en la SE15, en casos que tampoco tenían nexo epidemiológico con turismo.

Asimismo, se indicó que los casos con la mutación de interés L452Q (Andina) reportaron una suba desde la semana 7 hasta alcanzar el 57,7% de los casos en la semana 15, es decir a mediados de abril. De las muestras de GBA con esta mutación detectadas en semanas previas, 49 fueron confirmadas por secuenciación de genoma completo como linaje C.37, recientemente descubierto en Chile y Perú, llamaba de manera informal como "variante Andina".

A su vez, se explicó que únicamente el 3,8% de las secuencias de la última semana epidemiológica analizada corresponden a virus que han circulado en la primera ola en el Gran Buenos Aires; mientras que no se detectaron casos con las mutaciones E484K (P.2, Río de Janeiro) y L452R (compatible con la variante de California).

Dentro del mismo informe se incluyó un estudio realizado en el Gran La Plata, donde se observó que la distribución de variantes y mutaciones de interés epidemiológico en las SE13 y SE14 indicó un claro predominio de la variante 501Y.V3 (Manaos) con 27 de los 34 casos analizados.